Οργάνωση του γενετικού υλικού
Τεύχος Β΄ · Κεφ. 1 · Προκαρυωτικά, ευκαρυωτικά, καρυότυπος, μιτοχονδριακό DNA, ιοί
Πώς χωράνε 2 μέτρα DNA σε έναν πυρήνα;
Αν ξετύλιγες το DNA ενός μόνο κυττάρου σου, θα είχε μήκος περίπου 2 μέτρα. Ο πυρήνας έχει διάμετρο λίγα μικρόμετρα. Σε κλίμακα, είναι σαν να χωράς χιλιόμετρα ολόκληρα από πολύ λεπτή κλωστή μέσα σε ένα μπαλάκι του τένις — χωρίς να μπερδευτεί και με δυνατότητα να διαβάζεις όποιο κομμάτι θέλεις. Το μυστικό είναι η οργάνωση του γενετικού υλικού.
Το γενετικό υλικό ελέγχει τις λειτουργίες του κυττάρου
Οι πληροφορίες του DNA είναι οργανωμένες σε γονίδια. Τα περισσότερα γονίδια περιέχουν πληροφορίες για τη σύνθεση πρωτεϊνών, οι οποίες καθορίζουν τη δομή και τις λειτουργίες του κυττάρου. Το σύνολο του γενετικού υλικού ενός κυττάρου ονομάζεται γονιδίωμα.
Προκαρυωτικά κύτταρα
- Το γενετικό υλικό είναι ένα κυκλικό δίκλωνο μόριο DNA, που βρίσκεται σε μια περιοχή του κυτταροπλάσματος, το πυρηνοειδές, συνδεδεμένο με λίγες πρωτεΐνες.
- Πολλά βακτήρια περιέχουν επιπλέον πλασμίδια: μικρά κυκλικά δίκλωνα μόρια DNA που αντιγράφονται ανεξάρτητα από το κύριο μόριο. Φέρουν γονίδια που δεν είναι απαραίτητα για την επιβίωση υπό κανονικές συνθήκες, αλλά προσδίδουν πλεονεκτήματα — π.χ. ανθεκτικότητα σε αντιβιοτικά. Μεταφέρονται από βακτήριο σε βακτήριο.
Ευκαρυωτικά κύτταρα
- Το DNA του πυρήνα είναι οργανωμένο σε γραμμικά μόρια, καθένα από τα οποία αντιστοιχεί σε ένα χρωμόσωμα.
- Το DNA συνδέεται με πρωτεΐνες, κυρίως τις ιστόνες. Η βασική μονάδα οργάνωσης είναι το νουκλεόσωμα: DNA μήκους περίπου 146 ζευγών βάσεων τυλιγμένο γύρω από οκτώ μόρια ιστονών. Τα νουκλεοσώματα συνδέονται με DNA-συνδέτη, σαν «χάντρες σε κλωστή».
- Περαιτέρω αναδίπλωση σχηματίζει το ινίδιο της χρωματίνης. Κατά την κυτταρική διαίρεση η συσπείρωση γίνεται μέγιστη και σχηματίζονται τα μεταφασικά χρωμοσώματα.
- Το απλοειδές ανθρώπινο γονιδίωμα περιέχει περίπου ζεύγη βάσεων. Ένα σωματικό κύτταρο (διπλοειδές) έχει το διπλάσιο.
Η συσπείρωση επιτρέπει σε DNA μήκους περίπου 2 m να «χωρέσει» σε πυρήνα διαμέτρου λίγων μm.
Από τι αποτελείται ένα νουκλεόσωμα;
Ο ανθρώπινος καρυότυπος
Καρυότυπος είναι η απεικόνιση των μεταφασικών χρωμοσωμάτων ενός κυττάρου, ταξινομημένων σε ζεύγη ομολόγων κατά μέγεθος, θέση του κεντρομεριδίου και μοτίβο ζωνών μετά από χρώση.
Πώς παρασκευάζεται (συνήθως από λεμφοκύτταρα του αίματος):
- Καλλιέργεια των κυττάρων με ουσίες που διεγείρουν την κυτταρική διαίρεση.
- Προσθήκη ουσίας (π.χ. κολχικίνη) που σταματά τη διαίρεση στη μετάφαση, όπου τα χρωμοσώματα είναι πιο συσπειρωμένα.
- Επίδραση υποτονικού διαλύματος, ώστε τα κύτταρα να διογκωθούν και τα χρωμοσώματα να απλωθούν.
- Χρώση, φωτογράφηση και ταξινόμηση.
Ο φυσιολογικός ανθρώπινος καρυότυπος έχει 46 χρωμοσώματα: 22 ζεύγη αυτοσωμάτων και ένα ζεύγος φυλετικών (XX στη γυναίκα, XY στον άνδρα). Ο καρυότυπος χρησιμοποιείται για τη διάγνωση χρωμοσωμικών ανωμαλιών — όχι γονιδιακών μεταλλάξεων.
Μέχρι το 1956 τα βιβλία έγραφαν ότι ο άνθρωπος έχει 48 χρωμοσώματα. Τότε οι Joe Hin Tjio και Albert Levan, με βελτιωμένες τεχνικές (όπως το υποτονικό διάλυμα που «απλώνει» τα χρωμοσώματα), τα μέτρησαν σωστά: 46.
DNA μιτοχονδρίων, χλωροπλαστών και ιών
- Τα μιτοχόνδρια και οι χλωροπλάστες έχουν δικό τους κυκλικό δίκλωνο DNA, που μοιάζει με το DNA των βακτηρίων. Γι' αυτό είναι ημιαυτόνομα οργανίδια. Στον άνθρωπο το μιτοχονδριακό DNA κληρονομείται μόνο από τη μητέρα (τα μιτοχόνδρια του ζυγωτού προέρχονται από το ωάριο).
- Οι ιοί έχουν ως γενετικό υλικό DNA ή RNA — ποτέ και τα δύο. Το γενετικό τους υλικό μπορεί να είναι μονόκλωνο ή δίκλωνο, γραμμικό ή κυκλικό.
Στο mtDNA, άκουσε το «m» σαν «μαμά»: το μιτοχονδριακό DNA το παίρνεις μόνο από τη μητέρα σου, γιατί τα μιτοχόνδρια του ζυγωτού προέρχονται από το ωάριο.
Ένας ιός έχει γενετικό υλικό με 30% A, 30% U, 20% G, 20% C. Τι συμπεραίνουμε;
Μέθοδος: αναγνώριση του τύπου γενετικού υλικού
- T ή U; Θυμίνη → DNA· ουρακίλη → RNA.
- Ισχύουν (ή ) και ; Αν όχι → σίγουρα μονόκλωνο. Αν ναι → πιθανώς δίκλωνο.
- Ελεύθερα άκρα; Αν δεν υπάρχουν ελεύθερα 5΄/3΄ άκρα → κυκλικό (βακτηριακό, πλασμίδιο, μιτοχονδριακό).
- Ιστόνες; Σύνδεση με ιστόνες και νουκλεοσώματα → πυρηνικό DNA ευκαρυωτικού.
Παράδειγμα 1: Ένα μόριο νουκλεϊκού οξέος περιέχει T, και οι βάσεις του έχουν 22% A, 30% T, 28% G, 20% C. Τι είδους μόριο είναι;
Λύση: Περιέχει θυμίνη → DNA. Όμως και → μονόκλωνο DNA (π.χ. γενετικό υλικό ορισμένων ιών).
Παράδειγμα 2: Πόσα μόρια DNA περιέχει ο πυρήνας ενός ανθρώπινου σωματικού κυττάρου στη G1 και πόσα ένα σπερματοζωάριο;
Λύση: Σωματικό κύτταρο στη G1: 46 χρωμοσώματα, ένα μόριο DNA το καθένα → 46 μόρια πυρηνικού DNA. Σπερματοζωάριο: απλοειδές → 23. (Και στις δύο περιπτώσεις υπάρχουν επιπλέον πολλά αντίγραφα μιτοχονδριακού DNA.)
Άσκηση τύπου Πανελλαδικών: Να συγκρίνετε το γενετικό υλικό ενός βακτηρίου και ενός ανθρώπινου σωματικού κυττάρου ως προς: (α) τη μορφή του μορίου, (β) τη θέση του, (γ) τη σύνδεση με πρωτεΐνες, (δ) την ύπαρξη επιπλέον μορίων DNA.
Λύση:
(α) Βακτήριο: ένα κυκλικό δίκλωνο μόριο. Άνθρωπος: γραμμικά δίκλωνα μόρια (46 στο σωματικό κύτταρο).
(β) Βακτήριο: στο πυρηνοειδές του κυτταροπλάσματος. Άνθρωπος: στον πυρήνα (και κυκλικό DNA στα μιτοχόνδρια).
(γ) Βακτήριο: με λίγες πρωτεΐνες. Άνθρωπος: με ιστόνες, σχηματίζοντας νουκλεοσώματα και ινίδια χρωματίνης.
(δ) Βακτήριο: συχνά πλασμίδια. Άνθρωπος: μιτοχονδριακό DNA.
Ποια από τις παρακάτω μεθόδους χρησιμοποιείται για να διαγνωστεί μια χρωμοσωμική ανωμαλία;
Αναλύεις τέσσερα δείγματα γενετικού υλικού:
- Δείγμα 1: από βακτήριο, εκτός του κύριου μορίου DNA· κυκλικό, 5.000 ζεύγη βάσεων, A = T = 18%, G = C = 32%.
- Δείγμα 2: από ιό· γραμμικό, 5.000 ζεύγη βάσεων, ίδια σύσταση με το δείγμα 1.
- Δείγμα 3: από ιό· A 24%, U 24%, G 26%, C 26%.
- Δείγμα 4: από ιό· A 30%, T 20%, G 25%, C 25%.
(α) Χαρακτήρισε κάθε δείγμα. (β) Πόσους φωσφοδιεστερικούς δεσμούς και πόσους δεσμούς υδρογόνου έχουν τα δείγματα 1 και 2; (γ) Μπορεί τα δείγματα 3 και 4 να προέρχονται από τον ίδιο ιό;
Δοκίμασε πρώτα μόνος σου — μετά δες τη λύση
(α) 1: δίκλωνο κυκλικό DNA εκτός του κύριου μορίου → πλασμίδιο. 2: δίκλωνο γραμμικό DNA ιού. 3: έχει U → RNA· ισχύουν και , άρα πιθανώς δίκλωνο. 4: έχει T → DNA· → μονόκλωνο DNA.
(β) Φωσφοδιεστερικοί δεσμοί: στο κυκλικό, κάθε αλυσίδα 5.000 νουκλεοτιδίων έχει 5.000 δεσμούς → . Στο γραμμικό, . Δεσμοί υδρογόνου (ίδιοι και στα δύο): ζεύγη A–T , ζεύγη G–C → .
(γ) Όχι. Ένας ιός έχει ως γενετικό υλικό ή DNA ή RNA, ποτέ και τα δύο.
- «Τα πλασμίδια υπάρχουν στον πυρήνα.» Υπάρχουν σε βακτήρια (και σε ορισμένους ζυμομύκητες), στο κυτταρόπλασμα.
- «Ο καρυότυπος γίνεται σε οποιαδήποτε φάση.» Γίνεται με χρωμοσώματα μετάφασης.
- «Ο καρυότυπος δείχνει γονιδιακές μεταλλάξεις (π.χ. δρεπανοκυτταρική).» Όχι — δείχνει μόνο χρωμοσωμικές ανωμαλίες.
- «Ένας ιός μπορεί να έχει DNA και RNA.» Έχει ή DNA ή RNA.
- Γονιδίωμα: το σύνολο του γενετικού υλικού ενός κυττάρου· τα γονίδια ελέγχουν τη σύνθεση πρωτεϊνών.
- Προκαρυωτικά: ένα κυκλικό δίκλωνο DNA στο πυρηνοειδές + πλασμίδια (π.χ. ανθεκτικότητα σε αντιβιοτικά).
- Ευκαρυωτικά: γραμμικά μόρια DNA με ιστόνες → νουκλεοσώματα → χρωματίνη → μεταφασικά χρωμοσώματα.
- Καρυότυπος: 22 ζεύγη αυτοσωμάτων + XX ή XY· διάγνωση χρωμοσωμικών ανωμαλιών.
- Μιτοχόνδρια/χλωροπλάστες: κυκλικό DNA (mtDNA από τη μητέρα)· ιοί: DNA ή RNA, μονόκλωνο ή δίκλωνο.